Підземний (тільки станція Penn Station, Atlantic Terminal і Grand Central terminal)
AirTrain JFK є переважно піднесені, хоча є короткі сегменти, які проходять під землею або на рівні землі, що становить близько 1,5 милі (2,4 км).
Потяги LIRR прибувають і відправляються з печер двох станцій і через розташований тунель 140 футів (43 м) нижче Парк-авеню та більше ніж 90 футів (27 м) нижче колій Metro-North. Термінал LIRR містить чотири платформи та вісім шляхів (під номерами 201–204 та 301–304) у двох дворівневих печерах.
Колії метрополітену мають контактну рейку (третю рейку) ближче до ходової рейки, ніж колії LIRR і Metro-North.. На залізницях використовуються важчі (вищі) рейки. На залізничних стрілках (стрілках) і кривих використовується набагато довший радіус. Контактна рейка LIRR виготовлена зі сталі/алюмінію.
Залізнична дорога Лонг-Айленд надає послуги електро- та дизельного транспорту зі сходу на захід по всьому Лонг-Айленду.
Побудований на 15 поверхів під землею, проект включав станцію площею приблизно 700 000 квадратних футів, шість миль тунелю та 13 миль нової колії, 3 залізничні станції, 25 підстанцій та численні допоміжні об’єкти з очікуваними 162 000 пасажирами щодня.