Ці види зброї ніндзя включають довгі мечі, катана, вакідзасі, танто, сай і сюрікен. Зброю ніндзя не можна плутати з самурайськими мечами (катаною), які популяризували у фільмах, телешоу та книгах. Справа в тому, що ця зброя сильно відрізняється від самурайських мечів.
Ніндзюцу охоплює широкий спектр технік, починаючи з рукопашного бою до володіння різними видами зброї. Однак це мистецтво виходить за межі фізичних маневрів, включаючи розуміння людської психології, емоцій і навколишнього середовища.
Ніндзято (忍者刀), ніндзякен (忍者剣) або шинобігатана (忍刀) — це вважається улюбленою зброєю шинобі феодальної Японії, описаний на одному зображенні 21-го століття як людину, яку носять на спині, зокрема горизонтально на висоті приблизно до талії людини.
Досить цікаво, що ніндзя також були вправними у використанні вибухівки. Вони використовували димові гранати, міни та миготливі кулі щоб заплутати свого супротивника під час втечі, а також вибухові стріли та петарди.
Куноічі (Яп. くノ一, також くのいち або クノイチ) — це японський незвичайний термін для позначення «жінки» (女, онна). У популярній культурі воно часто використовується для жінок шинобі або практикуючих ніндзюцу (нінпо).