Розмір вікна кількість амінокислот, показники гідрофобності яких будуть усереднені та віднесені до середньої амінокислоти у вікні. Розмір вікна за замовчуванням становить 9 амінокислот.
На графіку зображено середню гідропатію рухомого сегмента фіксованого розміру вікна (яке вводить користувач), що рухається вздовж усієї послідовності. На ділянці, позитивний пік вказує на ймовірність того, що відповідний поліпептидний фрагмент є гідрофобним (негативний пік вказує на ймовірний гідрофільний сегмент).
Індекс гідропатії розглядає окремі амінокислоти та повідомляє вам, наскільки ймовірно, що амінокислота буде знайдена поблизу води, порівняно з. Як далеко від води, сюжет гідропатії забирає цю людину
Гідропатія сюжети дозволяють візуалізувати гідрофобність по довжині пептидної послідовності. Використовується шкала гідропатії, яка базується на гідрофобних і гідрофільних властивостях 20 амінокислот. Рухоме «вікно» визначає підсумкову гідропатію в кожній точці послідовності (координата Y).
Шкала Кайта-Дулітла є широко використовується для виявлення гідрофобних ділянок у білках. Ділянки з позитивним значенням є гідрофобними.
Для прогнозування можна використовувати графік гідропатії структура мембранного білка на основі його амінокислотної послідовності та значення гідрофобності амінокислот.