Основні групи мікроорганізмів, а саме бактерії, археї, гриби (дріжджі та цвілі), водорості, найпростіші та віруси— підсумовані нижче.
Мікроорганізми діляться на сім типів: бактерії, археї, найпростіші, водорості, гриби, віруси та багатоклітинні паразити тварин (гельмінти). Кожен тип має характерний клітинний склад, морфологію, засоби пересування та розмноження.
Існує п'ять різних категорій мікроорганізмів:бактерії, водорості, найпростіші, гриби та віруси— пояснюється більш детально в Mystery Microorganisms. Мікроорганізми охоплюють майже всі царства життя.
Найпоширенішими видами є бактерії, віруси та грибки.
Мікроби — це надто малі організми, щоб їх побачити без мікроскопа, тому до них належать бактерії, археї та одноклітинні еукаріоти — клітини, які мають ядро, як амеба або парамецій. Іноді ми також називаємо віруси мікробами.